狗狗窝底部有水可能有以下几个原因：

1. 天气潮湿或下雨，狗狗窝没有及时干燥，导致底部积水。

2. 狗狗窝的材质不透气或不防水，水分不能自然排出。

3. 狗狗在窝里吐了或大小便，没有及时清理干净。

4. 狗狗窝摆放的位置不当，水流容易流进窝内。

为了避免狗狗窝底部有水，需要定期清理窝内，保持干燥。选择透气、防水的材料制作狗狗窝，避免放置在潮湿的地方。同时，及时清理狗狗的大小便，避免积水。